El término municipal de La Villa de Agoncillo, pertenece al partido judicial de Logroño situado a 14 Km de éste. Se inscribe en la Subcomarca del Valle Bajo del Leza-Jubera (Rioja Media). Su término municipal se extiende 34,10 Km.

Los núcleos de población que pertenecen al término son: la Villa de Agoncillo, el barrio de Recajo, los Caseríos del Olivar, las Bodegas de la Atalayuela y la zona de San Martín.

El relieve topográfico de su asentamiento y de su entorno, está definido por una serie de terrazas formando amplios niveles escalonados. El paisaje describe un entorno de colinas y cumbres planas y cerros testigo creado por los terrenos de aluvión sedimentados por la confluencia de los ríos Ebro y Leza-Jubera.

Debido a éste asentamiento, la agricultura tradicionalmente ha sido su mayor fuente de riqueza. Esta agricultura, predominantemente de regadío dada su proximidad fluvial y las febriles tierras de aluvión, también ha sido de secano, concretamente de cereal como recoge en los documentos históricos.

También los cultivos de vid y olivos, espárragos y patatas, han sido importantes en éste sector, especialmente los dos primeros.

Actualmente, la cercana implantación del polígono industrial "El Sequero", ha sido causa de variaciones socio-demográficas, y han sido modificadas las tradicionales fuentes de riqueza, así como transformado el antropizado paisaje roturado.

En torno a la ganadería, podemos afirmar que tradicionalmente se ha criado ganado lanar incluso, ha servido de mercancía de cambio en transacciones económicas de interés histórico. También la cría de ganado porcino ha tenido interés y tradición.

De los rasgos paisajísticos aquí descritos, se desprende la importancia que en su configuración ha tenido el río Ebro, formando las terrazas características de los terrenos de aluvión, creando así un vado, descrito como tradicional paso de frontera, y lo decisivo de este hecho en la historia de Agoncillo, dada la incidencia del paisaje en la construcción histórica de los pueblos, sobre todo tratándose, como en éste caso, de un accidente geográfico de tal magnitud.